А о чём вы вообще спорите?
Нет никакого противоречия. Да, можно менять размер ЕДТ. Это повлечёт увеличения столбца во всех таблицах, где есть такие поля. Всё правильно. И да, на описанной таблице она (синхронизация) действительно будет очень долго выполняться.
Отличный выход предложил выше Андре. Единственный минус: об этом надо было задуматься раньше.
Счас переделывать будет всё равно долго по тем же причинам (перестройка таблицы в БД).
Конкретно в этой ситуации остаётся только ждать окончания синхронизации... Запастись интересными играми, сходить погулять там..