А у меня та ссылка уже месяц распечатана и подшита в папочку.
Там замечательный пример преобразования данных при импорте, но нет ни слова применительно к особенностям настройки групп определений с использованием реквизита "системные и общие таблицы" в 3.0.
В общем, свершилось все так, как сказал glibs.
Попался я вроде на том, что при создании группы определений не выбирал опции системные и общие таблицы, но потом добавлял их в список вручную. И делал импорт по этой группе определений.
Сделав же нормальную группу определений, выгрузив ее в двоичный файл и сделав "чистый" импорт без указания группы опредений, но с системными и общими таблицами, все получил в полном объеме и как хотел.