Я, конечно, понимаю, что это - паллиатив, но как насчет корректировки суммы всей накладной в формочке "Итоги" в диалоге разноски накладной?

Фактически, это эквивалентно тому, чтобы помимо корректировки налогов еще и скорректировать в сторону увеличения чистую сумму по строке в диалоге разноски.