Суммы при переносе берутся из мгновенной себестоимости остатков (если у вас не модель "Стандартные затраты", конечно
). Проверьте, у вас переносимая номенклатура вообще имеет отличную от нуля себестоимость остатков в разрезе аналитик финансовых запасов?