Использовать механизм внутреннего размещения:
Склад -> Обработка товаров по нескольким заказам -> Периодич. Задания -> Внутренние размещения.
Когда Вы учли подбор, товары из зоны подбора упали в зону отгрузки. Они лежат уже в ячейке отгрузки. Вам необходимо вернуть их назад, используя внутреннее размещение. Возращайте из зоны отгрузки и соответствующей ячейки назад, в ячейку подбора.
А дальше уже разберетесь, дело техники.
