Задача разноски журналов (не складских) в целом уже решена (правда не самым симпатичным образом). Если у тебя большие журналы, проставляешь поле Lines Limit в шапке журнала в, скажем, 500 строк. Потом запускаешь В ПАКЕТНОМ РЕЖИМЕ разноску выбранных журналов из Главная книга->Периодические операции->Разнести журналы (у меня нету русской версии под рукой, могу ошибаться в названии пункта меню). Система аккуратно разрезает твои журналы на несколько штук, по 500 строк в каждой, а потом их всех в параллельном режиме разносит.
Не очень удобно, конечно, с точки зрения возможности дальнейшей работы с разнесенными журналами, но жить можно.
С накладными тоже достаточно похоже: Если ты запускаешь разноску МНОЖЕСТВА накладных по многим заказам/закупкам (через Summary Update) в пакетном режиме, то каждая накладная будет создаваться в отдельном пакетном задании. Правда, если у тебя всего одна накладная, но большая - то тебе это никак не поможет. Но с другой стороны - накладные по 2000 строк каждый день и не разносятся