Какая у Вас версия Аксы? Дело в том, что в 4.0 появился функционал прямых отгрузок от поставщика клиентам, в 3.0 его не было. Поэтому ответ будет зависеть от версии.
Кстати, по правилам учета в РФ все равно придется куда-то приходывать товар.
Если Вы говорите про функционал заказов на перемещение, то он ОЧЕНЬ сырой, много придётся дописывать